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美國(guó)科學(xué)院院報(bào):暴發(fā)根源A類毒株相當(dāng)多見于非東亞地區(qū)
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柳葉刀不愛吃魚的大狗
最后更新: 2020-04-13 12:02:52【文/觀察者網(wǎng) 程小康】新冠病毒到底從哪里來?一直是國(guó)內(nèi)外輿論關(guān)注的焦點(diǎn)。因?yàn)槲錆h疫情最先爆發(fā),美國(guó)的一些政客在公開場(chǎng)合總是嚷嚷著“武漢病毒”、“中國(guó)病毒”,試圖污名化中國(guó)。
近期,關(guān)于新冠病毒起源問題的研究有了新進(jìn)展。最新的研究發(fā)現(xiàn),新冠A類與C類毒株相當(dāng)多的比例在東亞以外地區(qū)被發(fā)現(xiàn),B類在東亞國(guó)家,尤其中國(guó)大陸境內(nèi)常見。
A類病毒相當(dāng)多發(fā)現(xiàn)于非東亞地區(qū)
4月8日,一篇由英國(guó)和德國(guó)學(xué)者共同撰寫的論文,在國(guó)際知名學(xué)術(shù)期刊《美國(guó)科學(xué)院院報(bào)》(PNAS)上發(fā)表,文章題為《Phylogenetic network analysis of SARS-CoV-2 genomes》,第一作者為劍橋大學(xué)的Peter Forster博士。
截圖自《美國(guó)科學(xué)院院報(bào)》官網(wǎng)
論文內(nèi)容顯示,研究人員按照進(jìn)化關(guān)系,將新冠病毒變種分為A、B、C三類,A類與C類有相當(dāng)多比例在東亞以外地區(qū)被發(fā)現(xiàn)。相反,B類是東亞最常見的類型,B類的原始類型似乎沒有傳到東亞以外,直到最初的突變產(chǎn)生B類衍生型后才傳出去。這一現(xiàn)象指向奠基者效應(yīng)或東亞以外對(duì)B類原始型在免疫上或環(huán)境上的抗性。
2月3日,中國(guó)科學(xué)院武漢病毒研究所在《自然》雜志上發(fā)表的題為《A pneumonia outbreak associated with a new coronavirus of probable bat origin》論文,新冠病毒的基因組與蝙蝠冠狀病毒序列RaTG13相比,具有近96%的相似性。基于此研究,Peter Forster博士的研究團(tuán)隊(duì),在其論文中將蝙蝠攜帶的冠狀病毒設(shè)定為起源。
截圖自《自然》雜志官網(wǎng)
該研究團(tuán)隊(duì)使用了160個(gè)完成的病毒基因樣本,標(biāo)記為A、B、C三類。這些樣本在2019年12月24日至2020年3月4日期間,采集自世界各地。
因?yàn)锳類毒株與蝙蝠身上的冠狀病毒序列RaT13G相似,該研究團(tuán)隊(duì)將A類設(shè)定為“暴發(fā)根源(the root of the outbreak)”。
該論文指出,根據(jù)同一突變T29095C,A類可以明顯分為兩個(gè)子簇。在T突變子簇里,四個(gè)中國(guó)個(gè)體(來自華南沿海省份廣東)攜帶原始類型,三個(gè)日本和兩個(gè)美國(guó)病人與之不同,有一些突變差異。這些美國(guó)病人都有武漢居住史。
C突變子簇里有相當(dāng)長(zhǎng)的突變分支,包括5個(gè)武漢個(gè)體,其中兩個(gè)顯示在原始節(jié)點(diǎn)里。還包括8個(gè)來自中國(guó)和鄰國(guó)的東亞人。在C突變子簇里幾乎一半的類型(15/33),在東亞以外被發(fā)現(xiàn),主要在美國(guó)和澳大利亞。
論文數(shù)據(jù)表格
在論文的原始數(shù)據(jù)表格里, 針對(duì)C突變子簇,中國(guó)有12個(gè)(標(biāo)紅),包括臺(tái)灣、香港個(gè)1個(gè)。美國(guó)7個(gè)(標(biāo)藍(lán)),澳大利亞5個(gè)(標(biāo)紫),歐洲3個(gè)(標(biāo)綠),除東亞外的東亞國(guó)家6個(gè)(標(biāo)白)??梢?,C突變子簇中,非東亞國(guó)家占比15/33。
B類型病毒是包括中國(guó)在內(nèi)的東亞國(guó)家主要傳播類型,其中中國(guó)內(nèi)地占大多數(shù)。最后一種C類病毒,是歐洲的主要類型,在法國(guó)、意大利、瑞典和英國(guó)的早期病患中都有發(fā)現(xiàn),160個(gè)樣本中,中國(guó)大陸地區(qū)沒有出現(xiàn)該類型病毒,但在中國(guó)香港、中國(guó)臺(tái)灣、新加坡、韓國(guó)有發(fā)現(xiàn)。
值得注意是,有業(yè)內(nèi)專家指出,蝙蝠冠狀病毒序列RaTG13與新冠病毒雖然接近,但要用來確定“祖先”還差得太遠(yuǎn)。
對(duì)于該篇論文,英國(guó)愛丁堡大學(xué)的分子進(jìn)化生物學(xué)家Andrew Rambaut,連發(fā)推特,提出強(qiáng)烈質(zhì)疑:“這篇文章有許多地方都犯了大錯(cuò),包括內(nèi)容、發(fā)現(xiàn)和發(fā)布的途徑”、“首先是試圖用蝙蝠病毒RaTG13給新冠樹定根。這是最接近的非人病毒,但和新冠仍有超過1100個(gè)核苷酸的差異。然而請(qǐng)注意,由于某些原因,圖上連蝙蝠的分支比1100個(gè)核苷酸短些”、“實(shí)際上,關(guān)于內(nèi)容我想說的就這么多,根定錯(cuò)了,所有的結(jié)論(包括《每日郵報(bào)》里的那些)都得不到支持了”。
- 責(zé)任編輯: 柳葉刀 
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