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病毒學(xué)家挖掘1918年大流感蛛絲馬跡:季節(jié)性H1N1或是毒株直系后代
1918年,在第一次世界大戰(zhàn)的末尾,由甲型 H1N1 流感病毒引發(fā)的“西班牙流感”大流行(下稱(chēng)“1918年大流行”),橫掃美洲、歐洲、亞洲,甚至愛(ài)斯基摩人聚集區(qū)。在此次COVID-19之前,1918年大流行可謂是人類(lèi)歷史上最嚴(yán)重的流行病疫情,造成全球5000萬(wàn)至1億人死亡,這數(shù)據(jù)可能還存在嚴(yán)重低估。
盡管1918年有初步報(bào)告已經(jīng)猜測(cè),流感大流行是由病毒引起,但直到20世紀(jì)30年代這一猜測(cè)才被證實(shí),當(dāng)時(shí)有證據(jù)表明疾病與流感病毒有關(guān)。20世紀(jì)90年代末,科學(xué)家對(duì)1918年大流行時(shí)用福爾馬林固定、石蠟包埋的組織樣本和永凍保存的尸體進(jìn)行研究,最終確定病原體是H1N1亞型的甲型流感病毒(IAV)。
圍繞著這場(chǎng)世紀(jì)大災(zāi)難仍然有許多未解決或仍在爭(zhēng)論中的問(wèn)題。德國(guó)羅伯特·科赫研究所等團(tuán)隊(duì)的研究人員認(rèn)為,和分子分析工具推動(dòng)了該領(lǐng)域的研究類(lèi)似,從歷史檔案樣本中提取核酸的最新進(jìn)展也可以幫助他們?nèi)ヌ剿鱽?lái)自歐洲的病理學(xué)樣本。此前的樣本幾乎來(lái)自北美地區(qū)。
北京時(shí)間5月10日晚間,國(guó)際學(xué)術(shù)期刊《自然-通訊》(Nature Communication)在線發(fā)表了羅伯特·科赫研究所Se?bastien Calvignac-Spencer等人的一項(xiàng)最新研究,題為“歐洲流感病毒基因組檔案揭示了1918年流感大流行期間的基因組變異”( Archival influenza virus genomes from Europe reveal genomic variability during the 1918 pandemic)。Spencer是病毒進(jìn)化和高致病性微生物的流行病學(xué)方面的專(zhuān)家。
研究團(tuán)隊(duì)分析了德國(guó)和奧地利博物館歷史檔案中收藏的13個(gè)肺部樣本,這些樣本來(lái)自不同的個(gè)體,采集時(shí)間為1900年至1931年,其中6個(gè)樣本采集自歐洲大流行期間,即1918年(4個(gè))和1919年(2個(gè))。
對(duì)其中的3份流感陽(yáng)性樣本,即MU-162(慕尼黑)、BE-572(柏林)和BE-576(柏林)進(jìn)行測(cè)序,最后重建了MU-162的完整基因組和BE-572、BE-576的部分基因組(分別為89.3%和57.2%)。
結(jié)合此前科學(xué)家重建的兩個(gè)完整的IAV基因組,分別從1918年9月死于紐約厄普頓營(yíng)(CU)和1918年11月死于阿拉斯布雷維格(BM)的病例身上獲得,研究團(tuán)隊(duì)通過(guò)比較表明,存在可測(cè)量的基因組可變性,在相同大陸(0.11-0.16%)和在大流行同期(0.11%)采樣的基因組比在不同大陸(0.16-0.32%)和不同時(shí)期(0.16-0.21%)采樣的基因組總體差異更低。這些基因組多樣性與本土傳播和長(zhǎng)距離擴(kuò)散相結(jié)合的事件也是一致的。
對(duì)大流行高峰之前和期間的基因組進(jìn)行比較還顯示,1918年IAV與宿主抗病毒反應(yīng)和耐藥性相關(guān)的核蛋白基因的兩個(gè)位點(diǎn)發(fā)生了變異。研究團(tuán)隊(duì)認(rèn)為,這些突變可能代表了早期適應(yīng)人類(lèi)的特征:在其傳播的最初幾個(gè)月,1918年流感病毒可能進(jìn)化出更好的躲避先天干擾素反應(yīng)的能力,這是流感病毒致病性的一個(gè)重要方面。
研究團(tuán)隊(duì)還進(jìn)行了分子鐘建模,這種方法能用來(lái)估算演化的時(shí)間尺度。他們發(fā)現(xiàn),季節(jié)性H1N1流感病毒的所有基因組片段可能都是1918年大流感初始毒株的直接后代。這駁斥了認(rèn)為該季節(jié)性病毒來(lái)自基因重組(不同病毒的基因組片段發(fā)生互換)的其他假說(shuō)。研究同時(shí)強(qiáng)調(diào),鑒于建模方法的局限,目前證據(jù)還不能讓他們完全肯定地支持該結(jié)論。
論文最后還強(qiáng)調(diào)了他們的樣本量依然極為有限,基本來(lái)自3個(gè)完整基因組和2個(gè)部分基因組,因此這項(xiàng)研究的所有發(fā)現(xiàn)仍然是初步的。
但研究團(tuán)隊(duì)強(qiáng)調(diào),這項(xiàng)研究讓我們進(jìn)一步認(rèn)識(shí)了1918年流感大流行的演變和發(fā)展。同時(shí),團(tuán)隊(duì)預(yù)計(jì),更好地了解1918年大流感病毒進(jìn)化的主要障礙將在于對(duì)保存下來(lái)的病理標(biāo)本的鑒定,這同樣也體現(xiàn)出歷史檔案保存和使用的重要性。
(澎湃新聞?dòng)浾?賀梨萍)
- 原標(biāo)題:病毒學(xué)家挖掘1918年大流感蛛絲馬跡:季節(jié)性H1N1或是毒株直系后代
- 責(zé)任編輯: 林鈴錦 
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