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科研人員初步建立青藏高原水生微生物基因組和基因目錄

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2024-02-22 07:34:36 字號(hào)：A- A A+ 來(lái)源：中國(guó)新聞網(wǎng)

最后更新: 2024-02-22 10:48:14

中國(guó)科研人員搜集來(lái)自青藏高原濕地、淡水湖、鹽水湖、河流、溫泉和冰川等六種水生生態(tài)系統(tǒng)的498個(gè)水體環(huán)境DNA樣本，并進(jìn)行宏基因組測(cè)序，初步建立了青藏高原水生微生物基因組和基因目錄。相關(guān)成果于近日發(fā)表在國(guó)際學(xué)術(shù)期刊《自然-通訊》。

這項(xiàng)工作由中國(guó)科學(xué)院水生生物研究所研究員繆煒與華中科技大學(xué)團(tuán)隊(duì)合作完成?？姛?1日受訪時(shí)表示，上述基因組和基因目錄作為高海拔水生微生物資源的重要資源庫(kù)，蘊(yùn)藏著發(fā)現(xiàn)新的微生物譜系和功能的潛力，有助于拓展對(duì)全球微生物物種、遺傳和功能多樣性的認(rèn)識(shí)。

青藏高原是世界海拔最高的高原，獨(dú)特地形特征使其成為眾多河流的主要源頭，被譽(yù)為“亞洲水塔”。其類型多樣的水生態(tài)系統(tǒng)，孕育著豐富的水生微生物。

研究團(tuán)隊(duì)耗時(shí)4年，初步建立了青藏高原水生微生物基因組和基因目錄（Tibetan Plateau Microbial Catalog，簡(jiǎn)稱“TPMC”）?？姛樈榻B，TPMC目前包含3萬(wàn)多個(gè)中高質(zhì)量的原核微生物（細(xì)菌和古菌）宏基因組組裝的基因組，聚類為1萬(wàn)多個(gè)物種，其中88%為未注釋物種。此外，包含近3億個(gè)非冗余基因，其中15%為新基因；7萬(wàn)多個(gè)生物合成基因簇，50%為新基因簇。

利用這些數(shù)據(jù)，研究團(tuán)隊(duì)分析發(fā)現(xiàn)，青藏高原微生物組的微生物組成相似性和共有基因數(shù)量，隨著距離和海拔的差異增大而下降?！斑@一微生物的傳播模式提示青藏高原可能不僅扮演著‘水塔’的角色，還具有‘微生物塔’的作用?！笨姛樥f(shuō)。

繆煒表示，此項(xiàng)研究是中國(guó)科學(xué)院水生生物研究所牽頭發(fā)起的“萬(wàn)種原生生物基因組計(jì)劃”進(jìn)展之一。相關(guān)原核微生物基因組目錄已發(fā)布于國(guó)家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心。

（馬芙蓉孫慧）
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