不過這一回他的表現(xiàn)卻并沒有完全成為總統(tǒng)的得力助手。在“9·11”恐怖襲擊以后的那幾年里，美國展開了自身歷史上規(guī)模最大的反間諜和反恐怖主義行動，當(dāng)時剛剛設(shè)立的國土安全部也獲得了空前的權(quán)力，不僅在國外建立了諸如阿布格萊布和關(guān)塔那摩監(jiān)獄這樣的大型監(jiān)獄用于關(guān)押和審訊恐怖分子，還展開了針對國內(nèi)外甚至美國公民的大范圍大規(guī)模監(jiān)聽。這樣的行動在反恐戰(zhàn)爭初期被認為相當(dāng)必要，但隨著反恐戰(zhàn)爭的開展，美國國內(nèi)有關(guān)如此大規(guī)模監(jiān)聽是否必要，以及政府行動是否合法的爭議也愈演愈烈。

科米（左）與美國國家安全局（NSA）主管邁克爾·羅杰斯（右）?？泼自虿慌浜螻SA的行動而被后者認為是“刺頭”

在這一過程中，科米這樣受過系統(tǒng)法律教育的司法機構(gòu)人員的態(tài)度就顯得不那么配合。就在這一時期的2004年，他拒絕批準(zhǔn)延長國家安全局（NSA）的一項秘密監(jiān)聽項目。為此他甚至曾和一些執(zhí)法部門高官一起威脅辭職，其中就有現(xiàn)任聯(lián)邦調(diào)查局局長羅伯特·米勒。他的這一做法也得到國會內(nèi)不少議員、尤其是民主黨議員的稱贊。

隨后不久，科米就在2005年辭職離開了司法部，當(dāng)然這倒不是因為科米對司法部的工作有什么不滿，而更多是處于經(jīng)濟利益考慮：他成為了向五角大樓提供軍火的頭號供應(yīng)商——洛克希德馬丁公司的副總裁和法人代表。2010年之后幾年，他先后在一家對沖基金公司、哥倫比亞法學(xué)院謀職任教，并在2013年3月開始擔(dān)任匯豐銀行的董事。而在此之后不久，他就接到了美國總統(tǒng)奧巴馬的任命，成為了美國聯(lián)邦調(diào)查局的局長。

2013年9月4日，時任總統(tǒng)奧巴馬任命科米為美國聯(lián)邦調(diào)查局局長，任期十年

不過似乎是受了長期在司法工作“堅持獨立”的影響，或者是作為一名共和黨人的自覺，科米上任后同樣沒有對奧巴馬言聽計從。2014年8月9日，弗格森鎮(zhèn)手無寸鐵的18歲黑人青年布朗被白人警察威爾遜槍殺，這起事件在弗格森引發(fā)嚴重騷亂，并迅速波及美國各地，紐約、洛杉磯、費城、芝加哥等34個州的90座城市爆發(fā)抗議示威，引起全球關(guān)注。

弗格森騷亂事件引發(fā)全美一場有關(guān)種族問題、治安手段的論戰(zhàn)，總統(tǒng)奧巴馬、司法部長霍爾德以及聯(lián)邦調(diào)查局局長科米都參與其中。而其中科米的態(tài)度就明顯與奧巴馬不一致。他認為，總統(tǒng)批評地方警察執(zhí)法是綁住了警方的雙手，并在預(yù)防犯罪方面是事倍功半。

科米曾在希拉里的“郵件門”中扮演了重要角色

因為這種為保持獨立性甚至不惜與美國總統(tǒng)對抗的性格，導(dǎo)致了他在調(diào)查希拉里“郵件門”時受到共和黨和民主黨的不滿。根據(jù)2016年11月7日英國《每日郵報》網(wǎng)站報道，在白宮高級顧問瓦萊麗·加勒特的一再建議下，時任美國總統(tǒng)奧巴馬同意在大選結(jié)束后就解除科米的職務(wù)——實際上面對科米宣布重啟“郵件門”調(diào)查的決定，奧巴馬一開始不愿意解雇科米的原因，只是因為愛惜自己的羽毛——他不想因此面臨妨礙司法公正的指控，但他最后還是下令顧問團起草了解雇科米的方案。后來希拉里敗選時也公開指出，科米的調(diào)查是其失敗的重要因素。

而在司法部內(nèi)部，許多同樣認為司法體系應(yīng)該保持獨立的“老同志”，也認為科米的調(diào)查是利用美國官方權(quán)力對選舉的干涉。英國路透社曾經(jīng)引述一位司法部退休官員的話稱，“他們一致認為科米的愚蠢決策——在沒有掌握確鑿證據(jù)的情況下重啟調(diào)查，在沒有咨詢副手意見的情況下結(jié)束調(diào)查——著實令人驚愕，并且嚴重妨礙了專業(yè)執(zhí)法人員和檢察官的工作……不論科米之前享有怎樣的支持或公信力，現(xiàn)在都已經(jīng)蕩然無存了……他傷害了聯(lián)邦調(diào)查局的利益。只有奇跡發(fā)生，他才能躲過這一劫?！?

如此說來，如果不是特朗普贏得了大選，那么科米甚至連美國總統(tǒng)就職之后的這一百多天都待不下來，而是早就被留守的奧巴馬以一紙辭呈趕出聯(lián)邦調(diào)查局了。從這個角度看，科米在大選后就要卷鋪蓋走人，似乎是一件早已被共和黨和民主黨“雙重確定”的事情，他對“通俄門”調(diào)查的認真與否，只是決定了這份辭呈是找人走路送來還是直接塞進檔案里而已。

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